建设部直属的高校包括：
1. 哈尔滨建筑大学（合并于哈尔滨工业大学）
2. 重庆建筑大学（合并于重庆大学）
3. 沈阳建筑工程学院（现沈阳建筑大学）
4. 西北建筑工程学院（合并于长安大学）
5. 武汉城市建设学院（合并于华中科技大学）
6. 南京建筑工程学院（合并于南京工业大学）
7. 苏州城市建设环境保护学院（合并于苏州科技学院）
这些高校在建筑土木类专业方面具有较强优势，并且多数为211或985工程院校，提供良好的教育资源和就业平台
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